Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
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