Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NF1P21359 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NF1P21359 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NF1P21359 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NF1P21359 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NF1P21359 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NF1P21359 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NF1P21359 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NF1P21359 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NF1P21359 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NF1P21359 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms