Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2B1P20020 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms