Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD53P19397 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD53P19397 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD53P19397 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms