Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms