Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL5P13501 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL5P13501 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCL5P13501 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCL5P13501 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms