Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COX6A1P12074 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms