Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A1P11836 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A1P11836 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms