Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI2P10070 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI2P10070 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI2P10070 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI2P10070 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI2P10070 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI2P10070 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI2P10070 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI2P10070 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI2P10070 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI2P10070 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms