Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSIG8P0DPA2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms