Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM10L2BP0DMW5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms