Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms