Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB1P08034 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB1P08034 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB1P08034 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB1P08034 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJB1P08034 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms