Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLIT2O94813 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms