Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1FO60840 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1FO60840 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms