Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSNA1O43805 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSNA1O43805 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms