Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM6AO15550 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms