Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBDO15205 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBDO15205 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBDO15205 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBDO15205 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms