Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLGNO14967 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLGNO14967 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms