Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L21D6R901 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L21D6R901 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms