Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-1B6SEH8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms