Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms