Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf47A7E2U8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf47A7E2U8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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