Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM223BA6NKX1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms