Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms