Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L4A6NCW7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms