Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms