Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TM6SF1Q9BZW5 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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