Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ZBED3Q96IU2 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED3Q96IU2 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED3Q96IU2 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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