Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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