Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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