Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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