Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms