Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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