Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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