Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHPRHQ149N8 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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