Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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CHD4Q14839 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CHD4Q14839 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CHD4Q14839 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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CHD4Q14839 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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CHD4Q14839 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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CHD4Q14839 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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CHD4Q14839 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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CHD4Q14839 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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