Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM25Q14258 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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