Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VGLL4Q14135 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VGLL4Q14135 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms