Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms