Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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SHROOM2Q13796 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHROOM2Q13796 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SHROOM2Q13796 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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