Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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