Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCIRG1Q13488 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCIRG1Q13488 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCIRG1Q13488 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCIRG1Q13488 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCIRG1Q13488 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCIRG1Q13488 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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