Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms