Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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