Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRDNQ13061 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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