Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXF1Q12946 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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