Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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