Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
SOBPA7XYQ1 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms