Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms